Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.68□□□□□ -2.3
PUS1Q12211 PAU9YBL108C-A 129 nt0.67□□□□□ -2.3
PUS1Q12211 MLP1YKR095W 5628 nt0.65□□□□□ -2.31
PUS1Q12211 snR73snR73 106 nt0.62□□□□□ -2.31
PUS1Q12211 snR58snR58 96 nt0.59□□□□□ -2.31
PUS1Q12211 UTP10YJL109C 5310 nt0.58□□□□□ -2.32
PUS1Q12211 snR161snR161 161 nt0.53□□□□□ -2.32
PUS1Q12211 snR128snR128 126 nt0.51□□□□□ -2.33
PUS1Q12211 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.49□□□□□ -2.33
PUS1Q12211 URB1YKL014C 5295 nt0.33□□□□□ -2.36
PUS1Q12211 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.32□□□□□ -2.36
PUS1Q12211 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.28□□□□□ -2.36
PUS1Q12211 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt0.21□□□□□ -2.38
PUS1Q12211 snR87snR87 109 nt0.18□□□□□ -2.38
PUS1Q12211 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt0.09□□□□□ -2.4
PUS1Q12211 YOR309CYOR309C 381 nt0.07□□□□□ -2.4
PUS1Q12211 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.14□□□□□ -2.43
PUS1Q12211 snR33snR33 183 nt-0.33□□□□□ -2.46
PUS1Q12211 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.49□□□□□ -2.49
PUS1Q12211 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.49□□□□□ -2.49
PUS1Q12211 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.49□□□□□ -2.49
PUS1Q12211 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.62□□□□□ -2.51
PUS1Q12211 YNR077CYNR077C 255 nt-0.77□□□□□ -2.53
PUS1Q12211 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.8□□□□□ -2.54
PUS1Q12211 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-1.32□□□□□ -2.62
PUS1Q12211 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.37□□□□□ -2.63
PUS1Q12211 YDR543CYDR543C 300 nt-1.74□□□□□ -2.69
PUS1Q12211 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.16□□□□□ -2.76
PUS1Q12211 YJR162CYJR162C 351 nt-2.51□□□□□ -2.81
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.5 ms