Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-4.54□□□□□ -3.14
TY1B-BRQ12193 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-4.55□□□□□ -3.14
TY1B-BRQ12193 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-4.56□□□□□ -3.14
TY1B-BRQ12193 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-4.59□□□□□ -3.14
TY1B-BRQ12193 YOR225WYOR225W 330 nt-4.7□□□□□ -3.16
TY1B-BRQ12193 snR62snR62 100 nt-4.74□□□□□ -3.17
TY1B-BRQ12193 snR40snR40 97 nt-4.75□□□□□ -3.17
TY1B-BRQ12193 snR64snR64 101 nt-4.8□□□□□ -3.18
TY1B-BRQ12193 YLR294CYLR294C 330 nt-4.93□□□□□ -3.2
TY1B-BRQ12193 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-4.96□□□□□ -3.2
TY1B-BRQ12193 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-4.96□□□□□ -3.2
TY1B-BRQ12193 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-5.04□□□□□ -3.22
TY1B-BRQ12193 snR61snR61 90 nt-5.06□□□□□ -3.22
TY1B-BRQ12193 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-5.09□□□□□ -3.22
TY1B-BRQ12193 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-5.09□□□□□ -3.22
TY1B-BRQ12193 YNL338WYNL338W 159 nt-5.24□□□□□ -3.25
TY1B-BRQ12193 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-5.36□□□□□ -3.27
TY1B-BRQ12193 Q0032Q0032 291 nt-5.39□□□□□ -3.27
TY1B-BRQ12193 snR53snR53 91 nt-5.42□□□□□ -3.28
TY1B-BRQ12193 Q0144Q0144 330 nt-5.54□□□□□ -3.3
TY1B-BRQ12193 Q0143Q0143 153 nt-5.9□□□□□ -3.35
TY1B-BRQ12193 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-5.96□□□□□ -3.36
TY1B-BRQ12193 YMR326CYMR326C 309 nt-6.01□□□□□ -3.37
TY1B-BRQ12193 YHR217CYHR217C 462 nt-6.17□□□□□ -3.4
TY1B-BRQ12193 ATP8Q0080 147 nt-6.74□□□□□ -3.49
TY1B-BRQ12193 snR75snR75 89 nt-6.97□□□□□ -3.52
TY1B-BRQ12193 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-7.1□□□□□ -3.55
TY1B-BRQ12193 YBL109WYBL109W 336 nt-7.23□□□□□ -3.57
TY1B-BRQ12193 Q0092Q0092 141 nt-7.62□□□□□ -3.63
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.5 ms