Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnga1P29974 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnga1P29974 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnga1P29974 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms