Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2f6O54917 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
E2f6O54917 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms