Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bbip1J3QMK2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms