Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smco4Q9JIS3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smco4Q9JIS3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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