Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irx6Q9ER75 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms