Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Mrpl27Q99N92 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl27Q99N92 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mrpl27Q99N92 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl27Q99N92 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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