Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc30Q8BVF4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms