Protein–RNA interactions for Protein: Q12346

YPR071W, Uncharacterized membrane protein YPR071W, yeastyeast

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR071WQ12346 YHR217CYHR217C 462 nt0.95□□□□□ -2.26
YPR071WQ12346 SEC10YLR166C 2616 nt0.94□□□□□ -2.26
YPR071WQ12346 CSE1YGL238W 2883 nt0.93□□□□□ -2.26
YPR071WQ12346 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.93□□□□□ -2.26
YPR071WQ12346 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.93□□□□□ -2.26
YPR071WQ12346 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.93□□□□□ -2.26
YPR071WQ12346 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
YPR071WQ12346 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.93□□□□□ -2.26
YPR071WQ12346 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.93□□□□□ -2.26
YPR071WQ12346 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.93□□□□□ -2.26
YPR071WQ12346 MLP1YKR095W 5628 nt0.92□□□□□ -2.26
YPR071WQ12346 PET111YMR257C 2403 nt0.9□□□□□ -2.27
YPR071WQ12346 YJR029WYJR029W 5268 nt0.89□□□□□ -2.27
YPR071WQ12346 YOL014WYOL014W 375 nt0.89□□□□□ -2.27
YPR071WQ12346 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.88□□□□□ -2.27
YPR071WQ12346 BEM2YER155C 6504 nt0.88□□□□□ -2.27
YPR071WQ12346 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.87□□□□□ -2.27
YPR071WQ12346 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.86□□□□□ -2.27
YPR071WQ12346 snR69snR69 101 nt0.86□□□□□ -2.27
YPR071WQ12346 RPS26AYGL189C 360 nt0.86□□□□□ -2.27
YPR071WQ12346 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.84□□□□□ -2.28
YPR071WQ12346 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.83□□□□□ -2.28
YPR071WQ12346 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.83□□□□□ -2.28
YPR071WQ12346 EST1YLR233C 2100 nt0.83□□□□□ -2.28
YPR071WQ12346 YMR160WYMR160W 2451 nt0.81□□□□□ -2.28
YPR071WQ12346 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.81□□□□□ -2.28
YPR071WQ12346 snR81snR81 201 nt0.81□□□□□ -2.28
YPR071WQ12346 RDS3YPR094W 324 nt0.79□□□□□ -2.28
YPR071WQ12346 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.78□□□□□ -2.28
YPR071WQ12346 THO2YNL139C 4794 nt0.77□□□□□ -2.29
YPR071WQ12346 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.76□□□□□ -2.29
YPR071WQ12346 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.75□□□□□ -2.29
YPR071WQ12346 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.74□□□□□ -2.29
YPR071WQ12346 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.73□□□□□ -2.29
YPR071WQ12346 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.73□□□□□ -2.29
YPR071WQ12346 MLP2YIL149C 5040 nt0.72□□□□□ -2.29
YPR071WQ12346 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.72□□□□□ -2.29
YPR071WQ12346 ORC3YLL004W 1851 nt0.71□□□□□ -2.3
YPR071WQ12346 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.69□□□□□ -2.3
YPR071WQ12346 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.68□□□□□ -2.3
YPR071WQ12346 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.68□□□□□ -2.3
YPR071WQ12346 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.68□□□□□ -2.3
YPR071WQ12346 AI1Q0050 2505 nt0.65□□□□□ -2.31
YPR071WQ12346 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.65□□□□□ -2.31
YPR071WQ12346 MYO1YHR023W 5787 nt0.64□□□□□ -2.31
YPR071WQ12346 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.64□□□□□ -2.31
YPR071WQ12346 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.64□□□□□ -2.31
YPR071WQ12346 snR62snR62 100 nt0.58□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.58□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.57□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.56□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 UTP10YJL109C 5310 nt0.54□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.53□□□□□ -2.32
YPR071WQ12346 FMP27YLR454W 7887 nt0.51□□□□□ -2.33
YPR071WQ12346 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.46□□□□□ -2.34
YPR071WQ12346 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.45□□□□□ -2.34
YPR071WQ12346 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.45□□□□□ -2.34
YPR071WQ12346 snR50snR50 90 nt0.45□□□□□ -2.34
YPR071WQ12346 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.43□□□□□ -2.34
YPR071WQ12346 snR47snR47 99 nt0.42□□□□□ -2.34
YPR071WQ12346 ESP1YGR098C 4893 nt0.41□□□□□ -2.34
YPR071WQ12346 snR45snR45 172 nt0.4□□□□□ -2.35
YPR071WQ12346 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.39□□□□□ -2.35
YPR071WQ12346 SOV1YMR066W 2697 nt0.38□□□□□ -2.35
YPR071WQ12346 snR67snR67 82 nt0.37□□□□□ -2.35
YPR071WQ12346 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.37□□□□□ -2.35
YPR071WQ12346 RPL41AYDL184C 78 nt0.3□□□□□ -2.36
YPR071WQ12346 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.3□□□□□ -2.36
YPR071WQ12346 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.29□□□□□ -2.36
YPR071WQ12346 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.29□□□□□ -2.36
YPR071WQ12346 snR128snR128 126 nt0.22□□□□□ -2.37
YPR071WQ12346 YKL225WYKL225W 348 nt0.16□□□□□ -2.38
YPR071WQ12346 snR38snR38 95 nt0.15□□□□□ -2.39
YPR071WQ12346 snR64snR64 101 nt0.09□□□□□ -2.4
YPR071WQ12346 SKI7YOR076C 2244 nt0.06□□□□□ -2.4
YPR071WQ12346 snR53snR53 91 nt-0.02□□□□□ -2.41
YPR071WQ12346 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.04□□□□□ -2.42
YPR071WQ12346 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.1□□□□□ -2.43
YPR071WQ12346 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.11□□□□□ -2.43
YPR071WQ12346 SBH2YER019C-A 267 nt-0.16□□□□□ -2.44
YPR071WQ12346 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.17□□□□□ -2.44
YPR071WQ12346 YNR077CYNR077C 255 nt-0.2□□□□□ -2.44
YPR071WQ12346 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.26□□□□□ -2.45
YPR071WQ12346 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.27□□□□□ -2.45
YPR071WQ12346 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.29□□□□□ -2.46
YPR071WQ12346 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.3□□□□□ -2.46
YPR071WQ12346 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.31□□□□□ -2.46
YPR071WQ12346 snR161snR161 161 nt-0.41□□□□□ -2.48
YPR071WQ12346 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.3 ms