Protein–RNA interactions for Protein: Q08924

RTT10, Regulator of Ty1 transposition protein 10, yeastyeast

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Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT10Q08924 PAU24YBR301W 363 nt1.02□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 BEM2YER155C 6504 nt1.02□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 EST1YLR233C 2100 nt1.01□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 snR69snR69 101 nt1.01□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 MYO1YHR023W 5787 nt1□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt1□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.99□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 UTP20YBL004W 7482 nt0.99□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 PET111YMR257C 2403 nt0.98□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 RPS26AYGL189C 360 nt0.97□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.97□□□□□ -2.25
RTT10Q08924 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.95□□□□□ -2.26
RTT10Q08924 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.95□□□□□ -2.26
RTT10Q08924 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.94□□□□□ -2.26
RTT10Q08924 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.92□□□□□ -2.26
RTT10Q08924 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.92□□□□□ -2.26
RTT10Q08924 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.92□□□□□ -2.26
RTT10Q08924 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
RTT10Q08924 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
RTT10Q08924 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
RTT10Q08924 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
RTT10Q08924 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
RTT10Q08924 RDS3YPR094W 324 nt0.92□□□□□ -2.26
RTT10Q08924 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.88□□□□□ -2.27
RTT10Q08924 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.86□□□□□ -2.27
RTT10Q08924 ORC3YLL004W 1851 nt0.85□□□□□ -2.27
RTT10Q08924 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.85□□□□□ -2.27
RTT10Q08924 MLP1YKR095W 5628 nt0.85□□□□□ -2.27
RTT10Q08924 snR62snR62 100 nt0.83□□□□□ -2.28
RTT10Q08924 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.82□□□□□ -2.28
RTT10Q08924 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.82□□□□□ -2.28
RTT10Q08924 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.8□□□□□ -2.28
RTT10Q08924 YMR160WYMR160W 2451 nt0.8□□□□□ -2.28
RTT10Q08924 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.78□□□□□ -2.28
RTT10Q08924 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.78□□□□□ -2.28
RTT10Q08924 YOL014WYOL014W 375 nt0.76□□□□□ -2.29
RTT10Q08924 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.76□□□□□ -2.29
RTT10Q08924 snR45snR45 172 nt0.76□□□□□ -2.29
RTT10Q08924 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.75□□□□□ -2.29
RTT10Q08924 IQG1YPL242C 4488 nt0.72□□□□□ -2.29
RTT10Q08924 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.71□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.68□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 snR47snR47 99 nt0.68□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.67□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.67□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 UTP10YJL109C 5310 nt0.66□□□□□ -2.3
RTT10Q08924 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.64□□□□□ -2.31
RTT10Q08924 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.64□□□□□ -2.31
RTT10Q08924 snR50snR50 90 nt0.63□□□□□ -2.31
RTT10Q08924 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.61□□□□□ -2.31
RTT10Q08924 AI1Q0050 2505 nt0.58□□□□□ -2.32
RTT10Q08924 FMP27YLR454W 7887 nt0.55□□□□□ -2.32
RTT10Q08924 MLP2YIL149C 5040 nt0.53□□□□□ -2.33
RTT10Q08924 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.49□□□□□ -2.33
RTT10Q08924 snR67snR67 82 nt0.48□□□□□ -2.33
RTT10Q08924 RPL41AYDL184C 78 nt0.47□□□□□ -2.33
RTT10Q08924 THO2YNL139C 4794 nt0.46□□□□□ -2.34
RTT10Q08924 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.45□□□□□ -2.34
RTT10Q08924 SOV1YMR066W 2697 nt0.43□□□□□ -2.34
RTT10Q08924 ESP1YGR098C 4893 nt0.4□□□□□ -2.34
RTT10Q08924 YKL225WYKL225W 348 nt0.39□□□□□ -2.35
RTT10Q08924 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.37□□□□□ -2.35
RTT10Q08924 snR38snR38 95 nt0.37□□□□□ -2.35
RTT10Q08924 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.34□□□□□ -2.36
RTT10Q08924 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.34□□□□□ -2.36
RTT10Q08924 snR64snR64 101 nt0.32□□□□□ -2.36
RTT10Q08924 snR128snR128 126 nt0.27□□□□□ -2.37
RTT10Q08924 snR53snR53 91 nt0.21□□□□□ -2.38
RTT10Q08924 SKI7YOR076C 2244 nt0.2□□□□□ -2.38
RTT10Q08924 PAU9YBL108C-A 129 nt0.05□□□□□ -2.4
RTT10Q08924 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.02□□□□□ -2.41
RTT10Q08924 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.01□□□□□ -2.41
RTT10Q08924 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.06□□□□□ -2.42
RTT10Q08924 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.09□□□□□ -2.42
RTT10Q08924 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.12□□□□□ -2.43
RTT10Q08924 SBH2YER019C-A 267 nt-0.16□□□□□ -2.44
RTT10Q08924 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.23□□□□□ -2.45
RTT10Q08924 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-0.25□□□□□ -2.45
RTT10Q08924 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.27□□□□□ -2.45
RTT10Q08924 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.29□□□□□ -2.46
RTT10Q08924 snR161snR161 161 nt-0.35□□□□□ -2.47
RTT10Q08924 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.37□□□□□ -2.47
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