Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MitfQ08874 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MitfQ08874 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms