Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme1P97371 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme1P97371 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psme1P97371 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psme1P97371 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms