Protein–RNA interactions for Protein: P53924

DMA2, E3 ubiquitin-protein ligase DMA2, yeastyeast

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DMA2P53924 SIP4YJL089W 2490 nt1.17□□□□□ -2.22
DMA2P53924 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.17□□□□□ -2.22
DMA2P53924 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.17□□□□□ -2.22
DMA2P53924 RPS26AYGL189C 360 nt1.16□□□□□ -2.22
DMA2P53924 IML1YJR138W 4755 nt1.16□□□□□ -2.22
DMA2P53924 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.16□□□□□ -2.22
DMA2P53924 snR69snR69 101 nt1.15□□□□□ -2.23
DMA2P53924 PAU12YGR294W 363 nt1.14□□□□□ -2.23
DMA2P53924 PAU24YBR301W 363 nt1.14□□□□□ -2.23
DMA2P53924 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.12□□□□□ -2.23
DMA2P53924 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.12□□□□□ -2.23
DMA2P53924 VAM6YDL077C 3150 nt1.12□□□□□ -2.23
DMA2P53924 UTP20YBL004W 7482 nt1.11□□□□□ -2.23
DMA2P53924 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.11□□□□□ -2.23
DMA2P53924 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt1.1□□□□□ -2.23
DMA2P53924 RDS3YPR094W 324 nt1.1□□□□□ -2.23
DMA2P53924 EST1YLR233C 2100 nt1.08□□□□□ -2.24
DMA2P53924 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt1.07□□□□□ -2.24
DMA2P53924 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.04□□□□□ -2.24
DMA2P53924 snR81snR81 201 nt1.02□□□□□ -2.25
DMA2P53924 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.98□□□□□ -2.25
DMA2P53924 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.97□□□□□ -2.25
DMA2P53924 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.97□□□□□ -2.25
DMA2P53924 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.97□□□□□ -2.25
DMA2P53924 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.97□□□□□ -2.25
DMA2P53924 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.97□□□□□ -2.25
DMA2P53924 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
DMA2P53924 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.97□□□□□ -2.25
DMA2P53924 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.97□□□□□ -2.25
DMA2P53924 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
DMA2P53924 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.97□□□□□ -2.25
DMA2P53924 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.96□□□□□ -2.26
DMA2P53924 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.93□□□□□ -2.26
DMA2P53924 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.92□□□□□ -2.26
DMA2P53924 FMP27YLR454W 7887 nt0.92□□□□□ -2.26
DMA2P53924 ORC3YLL004W 1851 nt0.9□□□□□ -2.26
DMA2P53924 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.9□□□□□ -2.27
DMA2P53924 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.9□□□□□ -2.27
DMA2P53924 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.87□□□□□ -2.27
DMA2P53924 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.84□□□□□ -2.27
DMA2P53924 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.83□□□□□ -2.28
DMA2P53924 YOL014WYOL014W 375 nt0.82□□□□□ -2.28
DMA2P53924 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.79□□□□□ -2.28
DMA2P53924 YMR160WYMR160W 2451 nt0.77□□□□□ -2.29
DMA2P53924 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.75□□□□□ -2.29
DMA2P53924 snR62snR62 100 nt0.74□□□□□ -2.29
DMA2P53924 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.73□□□□□ -2.29
DMA2P53924 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.73□□□□□ -2.29
DMA2P53924 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.68□□□□□ -2.3
DMA2P53924 ESP1YGR098C 4893 nt0.67□□□□□ -2.3
DMA2P53924 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.66□□□□□ -2.3
DMA2P53924 UTP10YJL109C 5310 nt0.66□□□□□ -2.3
DMA2P53924 AI1Q0050 2505 nt0.64□□□□□ -2.31
DMA2P53924 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.63□□□□□ -2.31
DMA2P53924 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.63□□□□□ -2.31
DMA2P53924 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.63□□□□□ -2.31
DMA2P53924 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.63□□□□□ -2.31
DMA2P53924 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
DMA2P53924 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
DMA2P53924 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.63□□□□□ -2.31
DMA2P53924 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
DMA2P53924 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
DMA2P53924 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
DMA2P53924 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
DMA2P53924 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.58□□□□□ -2.32
DMA2P53924 snR50snR50 90 nt0.54□□□□□ -2.32
DMA2P53924 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.53□□□□□ -2.32
DMA2P53924 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.53□□□□□ -2.32
DMA2P53924 snR67snR67 82 nt0.51□□□□□ -2.33
DMA2P53924 SOV1YMR066W 2697 nt0.48□□□□□ -2.33
DMA2P53924 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.48□□□□□ -2.33
DMA2P53924 snR47snR47 99 nt0.48□□□□□ -2.33
DMA2P53924 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.45□□□□□ -2.34
DMA2P53924 snR45snR45 172 nt0.41□□□□□ -2.34
DMA2P53924 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.4□□□□□ -2.35
DMA2P53924 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.4□□□□□ -2.35
DMA2P53924 RPL41AYDL184C 78 nt0.39□□□□□ -2.35
DMA2P53924 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.38□□□□□ -2.35
DMA2P53924 THO2YNL139C 4794 nt0.38□□□□□ -2.35
DMA2P53924 snR128snR128 126 nt0.32□□□□□ -2.36
DMA2P53924 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.32□□□□□ -2.36
DMA2P53924 MYO1YHR023W 5787 nt0.23□□□□□ -2.37
DMA2P53924 YKL225WYKL225W 348 nt0.15□□□□□ -2.39
DMA2P53924 snR38snR38 95 nt0.08□□□□□ -2.4
DMA2P53924 snR64snR64 101 nt0.06□□□□□ -2.4
DMA2P53924 SKI7YOR076C 2244 nt0.01□□□□□ -2.41
DMA2P53924 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.06□□□□□ -2.42
DMA2P53924 snR53snR53 91 nt-0.08□□□□□ -2.42
DMA2P53924 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.09□□□□□ -2.42
DMA2P53924 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.16□□□□□ -2.44
DMA2P53924 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.16□□□□□ -2.44
DMA2P53924 SBH2YER019C-A 267 nt-0.19□□□□□ -2.44
DMA2P53924 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.19□□□□□ -2.44
DMA2P53924 URB1YKL014C 5295 nt-0.33□□□□□ -2.46
DMA2P53924 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.42□□□□□ -2.48
DMA2P53924 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.44□□□□□ -2.48
DMA2P53924 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.45□□□□□ -2.48
DMA2P53924 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
DMA2P53924 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
DMA2P53924 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.5□□□□□ -2.49
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