Protein–RNA interactions for Protein: P36088

YKL069W, Free methionine-R-sulfoxide reductase, yeastyeast

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL069WP36088 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YKL069WP36088 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YKL069WP36088 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YKL069WP36088 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YKL069WP36088 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YKL069WP36088 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YKL069WP36088 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.81□□□□□ -2.28
YKL069WP36088 YHR217CYHR217C 462 nt0.81□□□□□ -2.28
YKL069WP36088 EST1YLR233C 2100 nt0.81□□□□□ -2.28
YKL069WP36088 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.8□□□□□ -2.28
YKL069WP36088 RDS3YPR094W 324 nt0.8□□□□□ -2.28
YKL069WP36088 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.77□□□□□ -2.29
YKL069WP36088 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.77□□□□□ -2.29
YKL069WP36088 MLP2YIL149C 5040 nt0.77□□□□□ -2.29
YKL069WP36088 YBL109WYBL109W 336 nt0.76□□□□□ -2.29
YKL069WP36088 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.76□□□□□ -2.29
YKL069WP36088 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.71□□□□□ -2.3
YKL069WP36088 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.71□□□□□ -2.3
YKL069WP36088 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.71□□□□□ -2.3
YKL069WP36088 UTP20YBL004W 7482 nt0.71□□□□□ -2.3
YKL069WP36088 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.71□□□□□ -2.3
YKL069WP36088 ORC3YLL004W 1851 nt0.7□□□□□ -2.3
YKL069WP36088 snR81snR81 201 nt0.69□□□□□ -2.3
YKL069WP36088 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.69□□□□□ -2.3
YKL069WP36088 IML1YJR138W 4755 nt0.69□□□□□ -2.3
YKL069WP36088 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.67□□□□□ -2.3
YKL069WP36088 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.66□□□□□ -2.3
YKL069WP36088 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.64□□□□□ -2.31
YKL069WP36088 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.64□□□□□ -2.31
YKL069WP36088 MYO1YHR023W 5787 nt0.62□□□□□ -2.31
YKL069WP36088 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.61□□□□□ -2.31
YKL069WP36088 YMR160WYMR160W 2451 nt0.6□□□□□ -2.31
YKL069WP36088 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.58□□□□□ -2.32
YKL069WP36088 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.58□□□□□ -2.32
YKL069WP36088 UTP10YJL109C 5310 nt0.58□□□□□ -2.32
YKL069WP36088 FMP27YLR454W 7887 nt0.57□□□□□ -2.32
YKL069WP36088 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.55□□□□□ -2.32
YKL069WP36088 AI1Q0050 2505 nt0.54□□□□□ -2.32
YKL069WP36088 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.53□□□□□ -2.32
YKL069WP36088 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt0.51□□□□□ -2.33
YKL069WP36088 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.47□□□□□ -2.33
YKL069WP36088 snR62snR62 100 nt0.46□□□□□ -2.34
YKL069WP36088 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.45□□□□□ -2.34
YKL069WP36088 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.44□□□□□ -2.34
YKL069WP36088 snR50snR50 90 nt0.41□□□□□ -2.34
YKL069WP36088 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.36□□□□□ -2.35
YKL069WP36088 snR47snR47 99 nt0.36□□□□□ -2.35
YKL069WP36088 snR67snR67 82 nt0.35□□□□□ -2.35
YKL069WP36088 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.35□□□□□ -2.35
YKL069WP36088 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.34□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 ESP1YGR098C 4893 nt0.31□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.31□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt0.3□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 RPL41AYDL184C 78 nt0.28□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 snR128snR128 126 nt0.28□□□□□ -2.36
YKL069WP36088 SOV1YMR066W 2697 nt0.27□□□□□ -2.37
YKL069WP36088 snR45snR45 172 nt0.25□□□□□ -2.37
YKL069WP36088 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.24□□□□□ -2.37
YKL069WP36088 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.22□□□□□ -2.37
YKL069WP36088 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.18□□□□□ -2.38
YKL069WP36088 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.13□□□□□ -2.39
YKL069WP36088 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.08□□□□□ -2.4
YKL069WP36088 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.08□□□□□ -2.4
YKL069WP36088 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.08□□□□□ -2.4
YKL069WP36088 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.08□□□□□ -2.4
YKL069WP36088 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.08□□□□□ -2.4
YKL069WP36088 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.08□□□□□ -2.4
YKL069WP36088 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.08□□□□□ -2.4
YKL069WP36088 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.08□□□□□ -2.4
YKL069WP36088 YKL225WYKL225W 348 nt0.07□□□□□ -2.4
YKL069WP36088 THO2YNL139C 4794 nt0.01□□□□□ -2.41
YKL069WP36088 PAU9YBL108C-A 129 nt0□□□□□ -2.41
YKL069WP36088 snR38snR38 95 nt-0.02□□□□□ -2.41
YKL069WP36088 snR64snR64 101 nt-0.04□□□□□ -2.42
YKL069WP36088 SKI7YOR076C 2244 nt-0.05□□□□□ -2.42
YKL069WP36088 YOL014WYOL014W 375 nt-0.05□□□□□ -2.42
YKL069WP36088 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.06□□□□□ -2.42
YKL069WP36088 SBH2YER019C-A 267 nt-0.1□□□□□ -2.43
YKL069WP36088 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.16□□□□□ -2.44
YKL069WP36088 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.16□□□□□ -2.44
YKL069WP36088 snR53snR53 91 nt-0.2□□□□□ -2.44
YKL069WP36088 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.38□□□□□ -2.47
YKL069WP36088 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.39□□□□□ -2.47
YKL069WP36088 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-0.41□□□□□ -2.48
YKL069WP36088 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.42□□□□□ -2.48
YKL069WP36088 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.44□□□□□ -2.48
YKL069WP36088 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.44□□□□□ -2.48
YKL069WP36088 snR161snR161 161 nt-0.44□□□□□ -2.48
YKL069WP36088 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.56□□□□□ -2.5
YKL069WP36088 URB1YKL014C 5295 nt-0.59□□□□□ -2.5
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