Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kif3aP28741 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kif3aP28741 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms