Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhoP15409 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhoP15409 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhoP15409 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhoP15409 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms