Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms