Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
E2f6O54917 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2f6O54917 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
E2f6O54917 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms