Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efna3O08545 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efna3O08545 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Efna3O08545 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms