Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc8E9PWG2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms