Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CcniQ9Z2V9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CcniQ9Z2V9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CcniQ9Z2V9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CcniQ9Z2V9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcniQ9Z2V9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms