Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsc22d3Q9Z2S7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tsc22d3Q9Z2S7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tsc22d3Q9Z2S7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms