Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Crlf3Q9Z2L7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Crlf3Q9Z2L7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Crlf3Q9Z2L7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Crlf3Q9Z2L7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Crlf3Q9Z2L7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Crlf3Q9Z2L7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Crlf3Q9Z2L7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Crlf3Q9Z2L7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Crlf3Q9Z2L7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crlf3Q9Z2L7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Crlf3Q9Z2L7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crlf3Q9Z2L7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crlf3Q9Z2L7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crlf3Q9Z2L7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms