Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Trip6Q9Z1Y4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trip6Q9Z1Y4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trip6Q9Z1Y4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Trip6Q9Z1Y4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trip6Q9Z1Y4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trip6Q9Z1Y4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trip6Q9Z1Y4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trip6Q9Z1Y4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trip6Q9Z1Y4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Trip6Q9Z1Y4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trip6Q9Z1Y4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trip6Q9Z1Y4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trip6Q9Z1Y4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trip6Q9Z1Y4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trip6Q9Z1Y4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trip6Q9Z1Y4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trip6Q9Z1Y4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trip6Q9Z1Y4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trip6Q9Z1Y4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trip6Q9Z1Y4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trip6Q9Z1Y4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Trip6Q9Z1Y4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Trip6Q9Z1Y4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trip6Q9Z1Y4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trip6Q9Z1Y4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trip6Q9Z1Y4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trip6Q9Z1Y4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Trip6Q9Z1Y4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trip6Q9Z1Y4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trip6Q9Z1Y4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms