Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Setbp1Q9Z180 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Setbp1Q9Z180 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Setbp1Q9Z180 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Setbp1Q9Z180 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Setbp1Q9Z180 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Setbp1Q9Z180 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Setbp1Q9Z180 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Setbp1Q9Z180 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
Setbp1Q9Z180 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Setbp1Q9Z180 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Setbp1Q9Z180 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Setbp1Q9Z180 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Setbp1Q9Z180 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Setbp1Q9Z180 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Setbp1Q9Z180 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Setbp1Q9Z180 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Setbp1Q9Z180 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Setbp1Q9Z180 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Setbp1Q9Z180 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Setbp1Q9Z180 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Setbp1Q9Z180 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Setbp1Q9Z180 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Setbp1Q9Z180 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Setbp1Q9Z180 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Setbp1Q9Z180 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Setbp1Q9Z180 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Setbp1Q9Z180 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Setbp1Q9Z180 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Setbp1Q9Z180 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Setbp1Q9Z180 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Setbp1Q9Z180 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Setbp1Q9Z180 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Setbp1Q9Z180 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Setbp1Q9Z180 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Setbp1Q9Z180 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Setbp1Q9Z180 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Setbp1Q9Z180 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Setbp1Q9Z180 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Setbp1Q9Z180 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Setbp1Q9Z180 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Setbp1Q9Z180 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Setbp1Q9Z180 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Setbp1Q9Z180 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Setbp1Q9Z180 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Setbp1Q9Z180 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Setbp1Q9Z180 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Setbp1Q9Z180 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Setbp1Q9Z180 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Setbp1Q9Z180 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Setbp1Q9Z180 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Setbp1Q9Z180 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Setbp1Q9Z180 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Setbp1Q9Z180 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Setbp1Q9Z180 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
Setbp1Q9Z180 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Setbp1Q9Z180 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Setbp1Q9Z180 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Setbp1Q9Z180 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Setbp1Q9Z180 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Setbp1Q9Z180 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms