Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z109

Vsig2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig2Q9Z109 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vsig2Q9Z109 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vsig2Q9Z109 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vsig2Q9Z109 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vsig2Q9Z109 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vsig2Q9Z109 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsig2Q9Z109 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsig2Q9Z109 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsig2Q9Z109 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsig2Q9Z109 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsig2Q9Z109 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vsig2Q9Z109 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vsig2Q9Z109 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vsig2Q9Z109 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsig2Q9Z109 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vsig2Q9Z109 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vsig2Q9Z109 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vsig2Q9Z109 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vsig2Q9Z109 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vsig2Q9Z109 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vsig2Q9Z109 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig2Q9Z109 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig2Q9Z109 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig2Q9Z109 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vsig2Q9Z109 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms