Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hmg20bQ9Z104 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hmg20bQ9Z104 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hmg20bQ9Z104 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hmg20bQ9Z104 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hmg20bQ9Z104 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hmg20bQ9Z104 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hmg20bQ9Z104 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Hmg20bQ9Z104 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hmg20bQ9Z104 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hmg20bQ9Z104 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hmg20bQ9Z104 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hmg20bQ9Z104 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hmg20bQ9Z104 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Hmg20bQ9Z104 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hmg20bQ9Z104 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hmg20bQ9Z104 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hmg20bQ9Z104 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hmg20bQ9Z104 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hmg20bQ9Z104 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hmg20bQ9Z104 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hmg20bQ9Z104 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms