Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cib1Q9Z0F4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cib1Q9Z0F4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cib1Q9Z0F4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cib1Q9Z0F4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cib1Q9Z0F4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cib1Q9Z0F4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cib1Q9Z0F4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cib1Q9Z0F4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cib1Q9Z0F4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cib1Q9Z0F4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cib1Q9Z0F4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms