Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms