Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Katna1Q9WV86 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Katna1Q9WV86 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Katna1Q9WV86 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Katna1Q9WV86 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Katna1Q9WV86 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Katna1Q9WV86 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Katna1Q9WV86 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Katna1Q9WV86 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Katna1Q9WV86 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Katna1Q9WV86 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Katna1Q9WV86 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Katna1Q9WV86 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Katna1Q9WV86 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Katna1Q9WV86 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Katna1Q9WV86 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Katna1Q9WV86 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Katna1Q9WV86 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms