Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lemd3Q9WU40 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lemd3Q9WU40 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lemd3Q9WU40 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lemd3Q9WU40 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lemd3Q9WU40 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lemd3Q9WU40 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lemd3Q9WU40 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
Lemd3Q9WU40 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lemd3Q9WU40 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Lemd3Q9WU40 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Lemd3Q9WU40 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lemd3Q9WU40 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Lemd3Q9WU40 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Lemd3Q9WU40 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lemd3Q9WU40 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lemd3Q9WU40 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Lemd3Q9WU40 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Lemd3Q9WU40 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lemd3Q9WU40 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lemd3Q9WU40 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lemd3Q9WU40 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lemd3Q9WU40 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lemd3Q9WU40 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lemd3Q9WU40 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Lemd3Q9WU40 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Lemd3Q9WU40 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Lemd3Q9WU40 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Lemd3Q9WU40 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lemd3Q9WU40 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lemd3Q9WU40 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Lemd3Q9WU40 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Lemd3Q9WU40 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lemd3Q9WU40 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lemd3Q9WU40 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lemd3Q9WU40 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lemd3Q9WU40 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lemd3Q9WU40 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lemd3Q9WU40 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Lemd3Q9WU40 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lemd3Q9WU40 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lemd3Q9WU40 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lemd3Q9WU40 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lemd3Q9WU40 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Lemd3Q9WU40 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Lemd3Q9WU40 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Lemd3Q9WU40 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lemd3Q9WU40 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lemd3Q9WU40 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lemd3Q9WU40 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lemd3Q9WU40 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Lemd3Q9WU40 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lemd3Q9WU40 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Lemd3Q9WU40 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Lemd3Q9WU40 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lemd3Q9WU40 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lemd3Q9WU40 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lemd3Q9WU40 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Lemd3Q9WU40 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Lemd3Q9WU40 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Lemd3Q9WU40 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Lemd3Q9WU40 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Lemd3Q9WU40 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Lemd3Q9WU40 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Lemd3Q9WU40 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lemd3Q9WU40 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Lemd3Q9WU40 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms