Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Psmb3Q9R1P1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psmb3Q9R1P1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Psmb3Q9R1P1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psmb3Q9R1P1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psmb3Q9R1P1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Psmb3Q9R1P1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms