Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psma4Q9R1P0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psma4Q9R1P0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Psma4Q9R1P0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psma4Q9R1P0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms