Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt71Q9R0H5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt71Q9R0H5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt71Q9R0H5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt71Q9R0H5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt71Q9R0H5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms