Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
NrkQ9R0G8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
NrkQ9R0G8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
NrkQ9R0G8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NrkQ9R0G8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
NrkQ9R0G8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NrkQ9R0G8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
NrkQ9R0G8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
NrkQ9R0G8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
NrkQ9R0G8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.92
NrkQ9R0G8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
NrkQ9R0G8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
NrkQ9R0G8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
NrkQ9R0G8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NrkQ9R0G8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NrkQ9R0G8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
NrkQ9R0G8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NrkQ9R0G8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
NrkQ9R0G8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NrkQ9R0G8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NrkQ9R0G8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NrkQ9R0G8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NrkQ9R0G8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NrkQ9R0G8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
NrkQ9R0G8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
NrkQ9R0G8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NrkQ9R0G8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NrkQ9R0G8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.89
NrkQ9R0G8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
NrkQ9R0G8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NrkQ9R0G8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NrkQ9R0G8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NrkQ9R0G8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NrkQ9R0G8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NrkQ9R0G8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NrkQ9R0G8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
NrkQ9R0G8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
NrkQ9R0G8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NrkQ9R0G8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NrkQ9R0G8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NrkQ9R0G8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
NrkQ9R0G8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NrkQ9R0G8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NrkQ9R0G8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NrkQ9R0G8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NrkQ9R0G8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NrkQ9R0G8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NrkQ9R0G8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NrkQ9R0G8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NrkQ9R0G8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NrkQ9R0G8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NrkQ9R0G8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NrkQ9R0G8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NrkQ9R0G8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
NrkQ9R0G8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NrkQ9R0G8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NrkQ9R0G8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NrkQ9R0G8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
NrkQ9R0G8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
NrkQ9R0G8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NrkQ9R0G8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NrkQ9R0G8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
NrkQ9R0G8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
NrkQ9R0G8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NrkQ9R0G8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NrkQ9R0G8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NrkQ9R0G8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
NrkQ9R0G8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
NrkQ9R0G8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
NrkQ9R0G8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
NrkQ9R0G8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms