Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM0

Ubqln2, Ubiquilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln2Q9QZM0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubqln2Q9QZM0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubqln2Q9QZM0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubqln2Q9QZM0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubqln2Q9QZM0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubqln2Q9QZM0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms