Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SpastQ9QYY8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpastQ9QYY8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SpastQ9QYY8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SpastQ9QYY8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SpastQ9QYY8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms