Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tomm40Q9QYA2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tomm40Q9QYA2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tomm40Q9QYA2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tomm40Q9QYA2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm40Q9QYA2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms