Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kifc1Q9QWT9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kifc1Q9QWT9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kifc1Q9QWT9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kifc1Q9QWT9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kifc1Q9QWT9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kifc1Q9QWT9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kifc1Q9QWT9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kifc1Q9QWT9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifc1Q9QWT9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifc1Q9QWT9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kifc1Q9QWT9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kifc1Q9QWT9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kifc1Q9QWT9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kifc1Q9QWT9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kifc1Q9QWT9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kifc1Q9QWT9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms