Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dkk3Q9QUN9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Dkk3Q9QUN9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dkk3Q9QUN9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dkk3Q9QUN9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dkk3Q9QUN9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dkk3Q9QUN9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dkk3Q9QUN9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dkk3Q9QUN9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dkk3Q9QUN9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dkk3Q9QUN9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dkk3Q9QUN9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dkk3Q9QUN9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dkk3Q9QUN9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dkk3Q9QUN9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dkk3Q9QUN9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dkk3Q9QUN9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dkk3Q9QUN9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms