Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmx1aQ9JKU8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmx1aQ9JKU8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmx1aQ9JKU8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmx1aQ9JKU8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmx1aQ9JKU8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms