Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmod2Q9JKK7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmod2Q9JKK7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tmod2Q9JKK7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmod2Q9JKK7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tmod2Q9JKK7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmod2Q9JKK7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmod2Q9JKK7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmod2Q9JKK7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmod2Q9JKK7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmod2Q9JKK7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmod2Q9JKK7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmod2Q9JKK7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmod2Q9JKK7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmod2Q9JKK7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmod2Q9JKK7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmod2Q9JKK7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmod2Q9JKK7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmod2Q9JKK7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmod2Q9JKK7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmod2Q9JKK7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmod2Q9JKK7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmod2Q9JKK7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmod2Q9JKK7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms