Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mrpl39Q9JKF7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mrpl39Q9JKF7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mrpl39Q9JKF7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mrpl39Q9JKF7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mrpl39Q9JKF7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms