Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW4

Polm, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolmQ9JIW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolmQ9JIW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolmQ9JIW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PolmQ9JIW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolmQ9JIW4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolmQ9JIW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PolmQ9JIW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms