Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prmt1Q9JIF0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prmt1Q9JIF0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prmt1Q9JIF0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prmt1Q9JIF0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prmt1Q9JIF0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prmt1Q9JIF0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prmt1Q9JIF0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prmt1Q9JIF0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prmt1Q9JIF0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prmt1Q9JIF0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prmt1Q9JIF0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prmt1Q9JIF0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prmt1Q9JIF0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prmt1Q9JIF0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prmt1Q9JIF0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prmt1Q9JIF0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prmt1Q9JIF0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prmt1Q9JIF0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prmt1Q9JIF0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prmt1Q9JIF0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prmt1Q9JIF0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prmt1Q9JIF0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms