Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc15Q9JHS9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc15Q9JHS9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc15Q9JHS9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cwc15Q9JHS9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cwc15Q9JHS9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cwc15Q9JHS9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms