Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Brd4Q9ESU6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Brd4Q9ESU6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Brd4Q9ESU6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC42.47■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.39
Brd4Q9ESU6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Brd4Q9ESU6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Brd4Q9ESU6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Brd4Q9ESU6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Brd4Q9ESU6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Brd4Q9ESU6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Brd4Q9ESU6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Brd4Q9ESU6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Brd4Q9ESU6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Brd4Q9ESU6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
Brd4Q9ESU6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Brd4Q9ESU6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Brd4Q9ESU6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Brd4Q9ESU6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Brd4Q9ESU6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Brd4Q9ESU6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Brd4Q9ESU6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
Brd4Q9ESU6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Brd4Q9ESU6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
Brd4Q9ESU6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
Brd4Q9ESU6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Brd4Q9ESU6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Brd4Q9ESU6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Brd4Q9ESU6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Brd4Q9ESU6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Brd4Q9ESU6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Brd4Q9ESU6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Brd4Q9ESU6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Brd4Q9ESU6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Brd4Q9ESU6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Brd4Q9ESU6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Brd4Q9ESU6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Brd4Q9ESU6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Brd4Q9ESU6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Brd4Q9ESU6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
Brd4Q9ESU6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Brd4Q9ESU6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Brd4Q9ESU6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Brd4Q9ESU6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Brd4Q9ESU6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Brd4Q9ESU6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Brd4Q9ESU6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Brd4Q9ESU6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Brd4Q9ESU6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Brd4Q9ESU6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Brd4Q9ESU6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Brd4Q9ESU6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Brd4Q9ESU6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Brd4Q9ESU6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Brd4Q9ESU6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Brd4Q9ESU6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC42■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
Brd4Q9ESU6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Brd4Q9ESU6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Brd4Q9ESU6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
Brd4Q9ESU6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Brd4Q9ESU6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Brd4Q9ESU6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Brd4Q9ESU6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Brd4Q9ESU6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC41.88■■■■■ 4.3
Brd4Q9ESU6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Brd4Q9ESU6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Brd4Q9ESU6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Brd4Q9ESU6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Brd4Q9ESU6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Brd4Q9ESU6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Brd4Q9ESU6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Brd4Q9ESU6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Brd4Q9ESU6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms