Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ms4a4bQ9ES61 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a4bQ9ES61 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a4bQ9ES61 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms