Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc28a3Q9ERH8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc28a3Q9ERH8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc28a3Q9ERH8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc28a3Q9ERH8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc28a3Q9ERH8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc28a3Q9ERH8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc28a3Q9ERH8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc28a3Q9ERH8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc28a3Q9ERH8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc28a3Q9ERH8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc28a3Q9ERH8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc28a3Q9ERH8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc28a3Q9ERH8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms